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膜生物反应器通常分为内置式和外置式两种，两种方式各有不同，能耗相差较大。在处理复杂水质领域时，由于进水污染物浓度较高，为满足排放标准的要求，取得较好的处理效果，生物池内一般维持较高的污泥浓度，生化处理大多采用外置式MBR处理工艺。虽然外置式MBR工艺能够取得良好的处理效果，但也会导致运行成本大幅增加。
对于内置式MBR系统而言，只需要设置抽吸泵和膜清洗用鼓风机即可，其电耗远远低于外置式系统。
二、膜生物反应器的比较
1、 系统组成
对内置式和外置式膜进行比较的前提是，生物池内混合液悬浮物浓度相同，因此在膜前端的生物池对二者而言是相同的，只是对膜本身及其相关的配套设施进行比较。
内置式系统由膜池、膜组件、抽吸泵、清洗鼓风机及配套清洗设施组成，清洗鼓风机与曝气鼓风机统一放置在鼓风机房内，抽吸泵可以放置在室外膜池旁，整个系统的控制要求较低、运行管理也较简单。
外置式系统由进水泵、膜组件、循环泵及配套清洗设施组成，膜组件和循环泵需设在室内，进水泵可以放置在室外生物池旁，整个系统控制要求高、运行管理复杂。
2、工程投资和占地面积
内置式和外置式膜的通量有较大的差别，内置式膜的通量为12.5~32.5 L/(m2˙h)，外置式膜的通量为60~80 L/(m2˙h)，内置式膜系统需要建一座膜池，膜组件放在膜池内，但无需建膜处理间。而外置式膜系统无需建膜池，需建一座膜处理间，将膜组件放在室内，因此在处理相同水量的前提下，内置式膜需要的面积要远大于外置式膜的面积。由于受使用条件的限制，中空纤维膜承受的压力较低，而且加工难度较�。贾缕渖杀疽步系�。而管式膜需要承受较高的压力，加工难度大，其生产成本也相应较高。综合比较，在污水处理量相同的情况下，管式膜的综合造价要高于MBR中空纤维膜。
三、内/外置式MBR的特点如下：
1.外置式MBR特点：
① 通过泵将生化池内的污泥-水混合液直接打入膜管内，在压力的驱动下进行固液分离，透过膜的清水进入产水箱或直接排放，而浓液再次回到生化池继续参与生化反应。外置式MBR与传统MBR相比,省去了出水抽吸泵与间歇出水的控制单元，结构紧凑、占地面积�。子谑迪肿远刂�。
② 外置式MBR的膜组件安装在固液分离区的侧面，易于安装、拆卸，便于膜组件的维护和清洗。可应用于大型生活和工业污水处理。
2.内置式MBR特点：
① 内置式膜可以用于垃圾渗滤液处理较高污泥浓度的MBR生化处理系统，效果良好。
② 内置式膜系统的工程费用低于外置式膜系统。
③ 内置式膜系统的电耗远远低于外置式膜系统，运行成本大幅降低。
